Wissenschaftliche Literatur Bioinformatik

Iliya Petkov Peyneshki

Identification and Biochemical Characterization of Tat-dependent Beta-lactamases

HIPPOKRATES – Schriftenreihe Medizinische Forschungsergebnisse

Beta-lactam ring hydrolysis by beta-lactamases represents the primary resistance mechanism against beta-lactam antibiotics. Gram-negative bacteria employ two key protein translocation pathways across cytoplasmic membranes: the general secretory (Sec) and twin-arginine translocation (Tat) pathways. While most beta-lactamases utilize the Sec pathway, this study identifies a significant cluster of Tat-dependent beta-lactamases. A bioinformatic approach is presented to predict Tat-dependence, followed by biochemical validation and characterization using isogenic Y.…

Simone Kirstein-Jost

Auflösung von Anaphern im Rahmen der Informationsextraktion für Ontologie-Management im Bereich Life Sciences

Forschungsergebnisse zur Informatik

Im Bereich Life Sciences spielt die maschinelle Extraktion und strukturierte Speicherung von Informationen in Ontologien eine zunehmend wichtige Rolle. Zur Gewährleistung einer guten Informationsextraktion (IE) müssen Anaphern korrekt aufgelöst werden.

Im Rahmen dieser Studie wird untersucht, inwiefern der vollautomatische, wissensarme Ansatz von [Mitkov et al. 2002] (MARS) zur Anaphernauflösung für die Domäne Life Sciences im Rahmen der Informationsextraktion für das Ontologie-Management adaptierbar ist. Zunächst wird eine Einführung in die linguistischen…